อมิตาเดินทางข้ามเวลากลับมาปี 2000 แต่ทว่า...
อมิตาและอาจารย์ช่วยกันสร้างเครื่องข้ามเวลาได้สำเร็จแต่แล้ว...
อมิตาช่วยให้อาจารย์แอลทำการผ่าตัดได้สำเร็จ
อมิตาสามารถข้ามเวลาเพื่อมาพบโบจังตามที่พี่อาคิราบอก แต่แล้วก็พบว่าสถาบันอัลฟากลายเป็นสนามกอล์ฟอัลฟาไปซะแล้ว
อมิตาพบว่าเครื่องข้ามเวลาที่นำไปซ่อนหายไป อมิตาและโบจังจึงออกตามหาเครื่องเวลา แต่แล้วอมิตากลับพบว่า...